澎湖风电开发不只影响当地经济与供电，对台湾推动绿电也有关键性影响;台电规划在澎湖与云林间兴建海地电缆，将澎湖多余的风电输送到台湾，但这项计划遭到环团强烈反对，开发变量仍高。
澎湖是岛内适合开发风力发电的区域，一旦澎湖大规模开发风电，势必面临风电何处去的问题，台电预计在澎湖与云林口湖乡间兴建海底电缆，将余电送往台湾，但环团质疑这项计划会影响生态，还可能有电磁波影响民众健康，兴建过程屡遭居民抗议。
台电指出，该条电缆不但可以串连澎湖与台湾本岛的电网，让澎湖电力调度更经济与安全，未来澎湖发展风力发电的余电，可以藉此电缆输往台湾，有助台湾发展绿电。
台电主管说，澎湖发展风电达到一定规模后，因夜晚用电量低，澎湖风电多余的电力，可透过海底电缆输往台湾，作为日月潭夜晚抽蓄发电的电力。
台电主管解释，日月潭的抽蓄电厂，白天从上池放水发电，晚上再把水从下池抽往上池，类似电池储能的概念，利用夜晚便宜、多余的风电，担任抽蓄发电的电力，等于是在夜间储备绿能，在白天用电高峰时，再将绿能释放。
环团表示不反对发展低碳能源，但兴建海底电缆不应该牺牲当地居民权益，特别是高压电缆会经过学校、民宅附近，台电高压电缆埋设深度仅有2米，电磁波恐怕会影健康。
